Natla on nuori, kaunis vaaleahiuksinen nainen. Hän omistaa Natla Technologies yrityksen, joka on erikoistunut kaivauksiin. Natla tarjoaa Laralle työtä, joka on mielenkiintoinen ja haasteellinen. Laran täytyisi etsiä muinaiset Scionit, jotka tarinan mukaan omaavat suurempia voimia kuin itse Luojalla ja ovat avain kadonneeseen Atlantiksen pyramidiin. Natla jättää kuitenkin mainitsematta muutaman seikan. Hän on yksi muinaisen Atlantiksen hallitsijoista, joka syväjäädytettiin kauheiden rikosten takia, jottei saisi koskaan rauhaa. Hänen hallitsijatoverit, Tihocan ja Qualopec tuomitsivat hänet rikoksistaan. Ydinasekokeilut kuitenkin vapauttivat Natlan ja hän haluaa nyt Scionit itselleen, jotta voi saada Atlantiksen kukoistamaan jälleen. Natla on kehittänyt evoluutiota edemmäs luoden outoja mutantteja. Niiden avulla, hän haluaa vallata maapallon.
Natla siis huijaa Laraa keräämään Scionit ja varastaa ne häneltä. Hän myös määrää Laran tapettavaksi, mutta loppujen lopuksi, tuhoutuukin itse.
Tihocan ja Qualopec olivat siis Natlan ohella Atlantiksen hallitsijoista. He olivat myös ne, jotka tuomitsivat Natlan kauheista rikoksistaan yhdyskuntaa vastaan. He olivat jo melkein menettäneet valtansa Natlalle, joka hallitsi jo suurinta osaa Atlantista mutanteillaan. Heillä molemmilla oli oma Scioninsa ja Natlan vangitsemisen jälkeen, he jättivät Atlantiksen ja matkustaen kumpikin eri puolille maapalloa. Qualopec matkusti Peruun, vieden samalla oman Scioninsa turvaan sinne. Hän ja hänen seuraajansa perustivat kulttuurin, joka tunnetaan nykyäänkin Inka-kulttuurina. Tihocan puolestaan matkusti Italiaan vieden oman Scioninsa sinne, jottei kukaan saisi sitä koskaan käsiinsä. Hän rakensi Italialaisen luostarin alle labyrintin, jottei kukaan koskaan pääsisi hänen hautansa ja Scionin lähelle. Tihocanin tulon jälkeen perustettiin Rooma.
Pierre on Natlan kätyri, joka aiheuttaa Larallekin harmia matkansa aikana. Pierre on hyvin koulutettu Ranskalaismies, joka ei ole mitenkään hyvä lähitaistelussa. Älyä hänellä on kyllä, mutta kun hänen parinaan toimii Larson, joka on tyhmä kuin saapas, ei tulokset ole aina niin tehokkaita. Larson ja Pierre tapasivat Laran ensimmäistä kertaa Roomassa (TR5) kun he yrittivät saada Laralta viisasten kiven. Lara tappoi Pierren kuitenkin, kun he kävivät viimeistä taistoa Scionista.
Larson on teksasilainen mies, joka ei todellakaan ole älyllä pilattu. Pierren kanssa parivaljakon muodostava mies on aina hieman likainen, samoissa vaatteissa jotka ovat punainen paita, liivi, kulutetut farkut ja bootsit. Larsonin tyhmyys johtuu siitä, kun aasi potkaisi häntä lapsena päähän… Hän toimi siis Natlan alaisena Pierren kanssa ja tapasi Laran kahteen otteeseen. Ensimmäisen kerran Roomassa Viisasten kiven metsästyksessä, (TR5 Rooma tapahtumat sijoittuivat aikaan ennen TR1 peliä) jossa hän sai kyytiä lohikäärmekolmikolta ja sittemmin, Larson sai surmansa Laran ysimillisestä Tomb Raider 1:sessä.
Natlan kätyreitä. Vartioivat Natlan kaivauksia Atlantiksella ja yrittivät tappaa Laran.
Cowboy oli viiksekäs mies jolla oli hattu päässä ja ruskea liivi. Shotgun-Sam on kalju mies, jolla on valkoinen paita ja suuri kultaketju kaulassa. Skeittari oli nuori mies, ja hänellä oli käytössään kovat aseet ja huuteli koko ajan ärsyttäviä kommentteja.