Pariisi on kauhun vallassa. Sarjamurhaaja kulkee kaduilla ja kukaan ei uskalla olla enää ulkona. Kadut ovat autiot. Synkkiä, ”Monstrum” murhia on tapahtunut jo useita ja ruumiit ovat pahoin runneltuja. Kauhua on herättänyt myös se, että kunnioitettu arkeologi ja tutkimusmatkailija on tapettu.

On kulunut jonkin aikaa siitä, kun Lara pelastui Egyptistä ja oli Afrikkalaisen shamaanin hoidossa. Werner Von Croy on kutsunut Laran Pariisiin. Lara vastahakoisesti lähtee Pariisiin Von Croyn asunnolle. Kun Lara saapuu Von Croyn asunnolle, on Von Croy myös peloissaan. Hän kertoo Laralle, että on vastaanottanut työn, jota ei pysty hoitamaan. Lisäksi hänen työnantajansa on psykopaatti. Wernerin työnä on etsiä mystiset Obscura – maalaukset jotka hänen työnantajansa haluaa. Lara kysyy Werneriltä, että miksi hän auttaisi Werneriä? Tämä kun jätti hänet Egyptiin. Von Croy ojentaa kuitenkin käyntikortin Laralle ja käskee mennä tapaamaan kortissa olevaa henkilöä. Lara tiuskaisee Von Croylle että on menossa. Samassa, jotain tapahtuu. Werner huutaa kauhuissaan ja Lara lentää lattialle ja menee tajuttomaksi. Ase lentää sohvan alle. Kun Lara tulee tajuihinsa, hän löytää Wernerin ruumiin. Häntä on ammuttu. Lara ei muista tapahtumista mitään ja lähtee nopeasti asunnolta. Hän juoksee alakertaan ja poliisikoirat juoksevat hänen perässä. Lara yrittää päästä äkkiä kauas ja hyppää ikkunasta. Samalla kuitenkin, hänen reppunsa jää koirille. Harmissaan Laran täytyy kuitenkin jatkaa matkaansa pois asunnolta.

Kun Lara on paennut, on hänestä myös silminnäkijähavaintoja ja hän on nyt pääepäilty Werner Von Croyn murhassa. Tuntomerkit on jo annettu kansalle joten Laran täytyy varoa. Hän juoksee katuja pitkin löytääkseen kortissa olevan naisen, Margot Carvierin. Oudossa kaupungissa, se tuottaa ongelmia. Hän menee talonkattojen kautta kodittomien asunnolle ja kerää sieltä tarvikkeita. Hän palaa kadulle ja huomaa löytäneensä Margotin asunnon. Hän astuu sisään ja Margot päästää Laran sisälle kun hän kertoo kuka hänet on lähettänyt. Margot sanoo että nykyään pitää olla varovainen, kun on tapahtunut niin paljon. Lara on samaa mieltä ja kertoo, että Werner on kuollut. Kauhistuneena, Margot kysyy että onko Lara tappanut hänet. Lara sanoo, ettei muista mitä tapahtui, mutta on varma, ettei koskaan vahingoittaisi Werneriä. Epäilevä Margot kertoo Laralle, että on jotain mitä Werner halusi Laran saavan; muistikirjansa. Lara pyytää sitä Margotilta ja vastahakoisesti tämä lupaa antaa sen hänelle. Margot sanoo Laralle, että poliisi on pian asunnolla, että jos ei halua jäädä kiinni, hänen on parempi lähteä asunnolta. Lara kiirehtii ulos ikkunasta kun poliisit ovat jo rappukäytävässä.

Lara selaa muistikirjaa, muttei ymmärrä siitä vielä mitään. Koska on takaa-ajettu, ei hän voi mennä hotelliin. Hän menee Pariisin slummialueelle ja menee nukkumaan metroon. Hän luki muistikirjasta nimen Bouchard. Hänen on nyt saatava tuo mies käsiinsä. Niinpä hän lähtee kyselemään. Kukaan ei oikein osaa sanoa mitään ja sanovat ettei ole turvallista kysellä tuollaisia ja kulkea yksin kaduilla tällaisina aikoina. Lara tapaa kadulla kuitenkin naisen, Janicen. Janice on ilotyttö ja Lara saa nyhdettyä häneltä tietoja Bouchardista. Bouchard omistaa klubin, Serpent Rougen lähistöllä. Se on kuitenkin suljettu ongelmien takia. Työntekijät ovat lopettaneet ja joku jopa tapettu. Lara kysyy Janicelta, että tietääkö tämä niitä entisiä työntekijöitä. Janice myös sanoo, että juuri eilen illalla tapettiin taas yksi; Nainen, joku jonka nimi oli Carvier. Lara hätkähtää. Kyse ei voi olla kenestäkään muusta kuin Margot Carvierista.

Janice neuvoo Laraa menemään joko läheiseen puistoon tai paikalliseen kahvilaan, Café Metroon. Lara lähtee Cafe Metroon ja tapaa siellä kahvilan omistajan Pierren. Pierre lupaa auttaa Laraa jos hankkii jotain klubista, joka kuuluu hänelle. Lara lupaa auttaa. Hän lähtee etsimään Serpent Rougea. Päästessään sisään, hän katsoo valoja. Rasia, jonka Pierre haluaa, on rikkinäisessä diskolampussa, joten Laran täytyy kiivetä yläosiin. Hän lähtee klubin parvelle ja löytää kuitenkin muutaman työntekijän. Koska he kuuluvat Pariisin mafiaan, he ovat valmiita tappamaan tunkeilijan. Lara on onneksi löytänyt aseen klubin toimistohuoneesta ja pystyy jatkamaan matkaa hengissä. Hän saa mysteerirasian pois lampusta ja lähtee takaisin Pierren luo. Pierre antaa hieman tietoa Bouchardista ja ohjaa Laran tyttöystävänsä luo, joka voi auttaa Laraa pääsemään St. Aicardin hautausmaalle, jonka alapuolella Bouchard lymyää. Sitä ennen Lara käy kuitenkin St. Aicardin kirkossa ja löytää sieltä nyrkkeilyseuran. Valmentaja on Bouchardillekin toiminut Anton Gris. Lara lyö vetoa hänen kanssaan ja voittaa rahaa. Hän käy vielä Rennesin panttilainaamossa panttaamassa tavaraa saadakseen lisää rahaa. Laralla kun ei ole mitään, kun hänen reppunsakin jäi koirille.

Lara menee Pierren tyttöystävän kotiin. Nainen ohjaa hänet St. Aicardin hautausmaalle ja Lara menee yhden haudan kautta hautausmaan alla oleviin viemäreihin. Hän löytää Bouchardin joka on hieman varuillaan. Lara sanoo tarvitsevansa apua, sillä hänen ystävänsä on tapettu. Lara tarvitsee aseita ja repun. Bouchard kertoo pystyvänsä auttamaan mutta haluaa Laralta vastapalveluksen. Laran täytyy viedä laittomia passeja Rennesille. Vastahakoisesti Lara lupautuu viemään ne Rennesille. Rennesiltä hän saa tarvitsemansa tavarat. Lara lähtee matkaan ja astuu Rennesin panttilainaamoon. Käytävässä häntä tulee vastaan outo mies. Mies tönäisee Laraa mennessään ulos. Lara astuu kuitenkin panttaamoon ja laittaa passit pöydälle. Kun Rennesiä ei näy, hän menee takahuoneeseen. Hän löytää Rennesin maasta, tapettuna. Lattiassa on outo symboli, joka on tehty verellä. Lara tietää olevansa lähellä murhaajaa. Hän menee Rennesin varastoon ja ottaa sieltä aseet. Hän laukaisee hälytyksen ja ajastettu pommi alkaa tikittää. Laralle tulee kiire päästä ulos. Hän huomaa lattialuukun ja menee sen kautta viemäriin. Räjähdys seuraa häntä ja Lara hyppää äkkiä jokeen. Joku katsoo Laraa joen toiselta puolelta. Sama mies, joka istui Pierren kahvilassa aiemmin ja lähti kiireellä moottoripyörällä.

Lara lähtee kohti Louvrea. Hän on ostanut itselleen uudet tarvikkeet, sillä matka onkin osoittautunut entistä mutkikkaammaksi. Hän on Louvren viemäreissä, joiden kautta hänen on päästävä Louvren taidegalleriaan. Lara sammuttaa viemärijärjestelmän päästäkseen eteenpäin. Sitten hän joutuu räjäyttämään aukon seinään, joka erottaa hänet Louvren gallerian pohjakerroksesta. Allas on kuitenkin öljyssä, joka syttyy palamaan. Lara pääsee kuitenkin Louvren taidegallerian pohjakerrokseen.

Galleria, niin kuin saattaa odottaakin, on hyvin vartioitu. Laran täytyy päästä kuitenkin Margotin työhuoneeseen, sillä sieltä hän saa pääsyn arkeologisille kaivauksille. Laran täytyy selvittää lasersäteet koskematta niihin päästäkseen gallerian toiseen osaan. Toisessa huoneessa, hän sammuttaa laserit Mona Lisa maalauksen edessä ja kiipeä juuri ajoissa ilmastointikanavaan. Sen kautta, hän pääsee Louvren katolle. Katolta, hän jatkaa Louvren työntekijöiden huoneiden ja tutkimushuoneiden kerrokseen. Lara jatkaa vartioiden huoneeseen ja keksii käyttää infrapunakameraa katsoakseen Margotin huoneeseen. Huoneesta hän löytääkin oven koodin. Se on kiinni tietokoneessa. Lara pistää muistiin numeron ja juoksee huoneeseen. Sieltä hän löytää Margotin henkilökortin, jolla on pääsy Gallerian jokaiseen osaan. Lisäksi, hän oppii lisää Obscura maalauksista. Mystiset maalaukset ovat peräisin 1300 luvulta ja omaavat omituiset voimat ja niiden sisällä on jonkinlaiset metalliosat.

Lara lähtee takaisin kohti arkeologisten kaivausten sisäänkäyntiä. Hän vetää Margotin kortin lukijan läpi ja pääsee sisään kaivauksille. Vartijat hoideltuaan, hän näkee kaivauksilla jotain outoa. Seinässä on jonkinlainen muinainen koodirakennelma, jossa pyörii erilaisia symboleita. Lara vilkaisee muistikirjaa. Von Croy on jo selvittänyt niistä osan. Muistikirja vihjaa myös, että Röntgenhuoneessa on kolmas merkki. Lara katsoo merkin röntgenillä maan sisästä. Viimeisen merkin hän löytää yhdestä parakista. Hän kiipeää nyt rakennelman luo ja pysäyttää merkit jotka hän on saanut. Ylempänä portti aukeaa. Lara on ensimmäinen, joka astuu tästä portista vuosisatoihin.

Lara hyppää sisään portista. Hän kävelee käytävää eteenpäin ja tulee valtavaan kuiluun. Muinaisten hauta. Alapuolella menee jonkinnäköinen silta. Lara hyppää sinne ja vivusta vedettyään, seinästä tulee esiin palkit. Lara menee niitä pitkin alas. Alhaalla odottaa luurankoritari. Kuolleita ei voi tappaa, joten Lara kiirehtii vain seuraavan vivun luo. Hän jatkaa esiin tulleiden palkkien kautta kolmannelle vivulle joka avaa oven eteenpäin. Lara menee siitä ja hetken päästä saapuu Vuodenaikojen Huoneeseen. Saadakseen yhden Obscura maalauksista, Laran on selvitettävä Vuodenaikojen huone. Hänen on kerättävä neljä peruselementin kristallia, saadakseen muinaisen polttouunin toimimaan. Lara kerää ansojen lomassa Sanctuary of the Flamen tulikristallin, Hall of Neptunen vesikristallin, Wrath of the Beastin maakristallin ja Breath of Hades ilmakristallin. Hän vie ne paikoilleen ja jatkaa matkansa vuodenaikojen huoneen alapuolelle, jossa on laavaa ja ansoja. Hän löytää tien polttouunin ovelle ja alkaa kääntää vipuja saadakseen polttouunin toimimaan. Uuni herää henkiin ja Lara pääsee nyt vuodenaikojen huoneen toiseen kerrokseen. Sieltä kautta hän kiipeää huoneeseen, jota Veli Obscura, haamu, vartioi. Laran täytyy siepata maalaus silloin, kun on jähmettänyt haamun. Lara nappaa maalauksen nopeasti ja kiirehtii ulos. Vesi alkaa täyttää huonetta. Kun Lara pääsee Muinaisten haudalle, se on jo veden vallassa. Hän ui nopeasti pintaan ja palaa takaisin Louvren galleriaan arkeologisten kaivauksien kautta.

Sillä välin, Cabal pitää kokousta. Eckhardt kertoo, että heillä on jo 3 Obscura maalausta ja Eckhardt sanoo kumppaneilleen, että on aika herättää, Nukkuja. Samalla hän käskee Gundersonin kerätä joukot neljättä maalausta varten. Palatessaan gallerialle, Lara huomaa että se on väijytyksen alaisena. Kuka tietää myös maalauksista, että haluaa ne niin epätoivoisesti itselleen. Lara hiipii tiensä sisään ja käyttää hiljaisia aseita. Miehet vapauttavat kyynelkaasua ja Laran on löydettävä hengityssuojain. Hän muistaa tällaisen olevan tutkimushuoneessa ja noutaa sen nopeasti sieltä. Päästessään uloskäynnin lähelle, joku hiipii Laran taakse. Vihaisena itselleen, Lara on unohtanut suojata selustansa. Mies. Mies ottaa Laralta aseet ja Lara kääntyy nopeasti ympäri. Sama mies, joka oli Pariisilaisessa kahvilassa. Mies jättää Laran siihen ja lähtee juoksemaan pois. Lara lähtee nopeasti perään, samalla kun aseistetut sotilaat juoksevat hänen kannoillaan. Lara seuraa miestä ulos ja löytää tämän yhtäkkiä tajuttomana maasta. Samassa, Lara lyödään tajuttomaksi.

Lara herää jonkun ravistellessa häntä. Bouchard. Lara ihmettelee Bouchardin läsnäoloa mutta löytää omituisen veitsen maasta. Ja huomaa, että hänen löytämänsä Obscura maalaus on kadonnut. Bouchard sanoo, että tuli apuun koska Lara herätti niin paljon huomiota. Lara pyytää Bouchardia viemään hänet Von Croyn asunnolle. Päästessään sen luo, Lara kiittää Bouchardia ja poistuu sisälle Von Croyn taloon. Kun Lara on poissa näköpiiristä, Bouchard paljastaa todellisen karvansa. Hän käskee palkkamurhaajan Laran perään taloon.

Lara astuu sisälle Von Croyn asuntoon. Se on aivan myllättynä ja täynnä verisiä merkkejä. Samankaltaisia, mitä Rennesin panttaamossa oli. Lara näkee nyt välähdyksiä. Hän ei tappanutkaan Von Croyta! Se oli se omituinen mies, joka tuli häntä vastaan Rennesin kaupassa! Huojentuneena, Larasta tulee entistä päättäväisempi. Hänen on löydettävä murhaaja ja puhdistettava maineensa. Hän kerää aseita ja tarvikkeita Von Croyn asunnosta ja lukee samalla tämän tutkimuksia Obscura maalauksista. Hän lukee mielenkiintoisen jutun Cabal – nimisestä järjestöstä, joka on vuosisatoja yrittänyt etsiä maalauksia itselleen. Lisäksi hän lukee järjestöstä nimeltä Lux Veritatis, joka on myös vuosisatoja taistellut pimeyden voimia ja Cabalin Mustaa Alkemistia vastaan, ja että juuri tämä järjestö, suomeksi ”Totuuden Valo” on piilottanut Obscura maalaukset, jottei Cabal saisi niitä käsiinsä. Kesken tutkimustensa, palkkamurhaaja ”Siivooja” on tullut asuntoon. Lara menee äkkiä suojan ja vastaa tulitukseen. Siivooja katoaa hetkeksi ja Lara seuraa perässä. Pitkin rappukäytäviä ja toisten asuntoja Lara seuraa siivoojaa, kunnes saa palkkamurhaajan pois päiviltä. Hän löytää miehen taskusta puhelimen. Puhelimen, jossa puhuu tuttu ääni. Bouchard. Bouchard kysyy, että joko nainen on tapettu, ja Lara vastaa olevansa hengissä. Lara käskee nyt Bouchardin kuljettaa hänet Prahaan, Monstrum murhien tapahtumapaikalle.

Lara saapuu Prahaan ja tutkii hieman ympärilleen. Hän huomaa kauempana miehen joka seisoo autonsa vieressä. Lara menee puhumaan hänelle. Mies osoittautuu toimittajaksi nimeltä Luddick, joka tutkii murhia ja on kiinnostunut mafiasta. Hän näyttää Laralle ottamiaan kuvia ja Lara tunnistaa miehen kuvassa. Eckhardt. Lara pyytää Luddickilta apua. Laran täytyy maksaa hänelle ja Luddick lupaa hankkia hänelle pääsyn Strahoviin, Cabalin päämajaan. Lara maksaa hänelle ja he sopivat tapaamisen myöhemmäksi. Lara lähtee tutkimaan paikkaa lisää. Hän menee rakennukseen varaston kautta, ja löytää sieltä Bouchardin. Lara laittaa tämän käsiraudoilla kiinni patteriin ja käskee hänen pysyä siinä kun Lara itse käy sisällä rakennuksessa. Lara tulee valtavaan kirjastoon. Hänen täytyy siirtää huoneessa olevaa kelloa ja sitten hän pääsee kirjaston alla sijaitsevaan huoneeseen. Vasileyn työhuone, niin kuin Von Croyn muistikirjassa sanotaan. Lara laittaa faksista löytämänsä koodin suuren seinämaalauksen viereen ja löytää sieltä yhden Obscura – maalauksista. Lara katsoo vielä Vasileyn kokoelmaa. Siellä on tietoa puukoista nimeltä Periapt Shard. Lara huomaa omistavansa yhden niistä. Hän jatkaa matkaansa takaisin Bouchardin luo mutta huomaa, että hän ei ole enää siinä. Hän menee käytävään ja katsoo ovien takaa. Siivouskomerosta, Laran päälle kaatuu Bouchardin ruumis. ”Mitä helvettiä täällä on tekeillä?!” Lara huutaa vihaisena.

Hän menee Luddickin luo, joka ojentaa Laralle alhaisen turvajärjestelmän henkilökortin. Parempaan hän ei pystynyt. Lara kuitenkin lähtee kohti Strahovia. Hän tulee Strahovin lastausalueelle. Hän hiipii tiensä toiselle puolelle vartioitua aitaa ja pääsee lähemmäs tutkimuskeskusta. Laran on löydettävä tie biologiseen tutkimuskeskukseen. Lara käyttää hallissa olevaa suurta sirkkeliä katkaistakseen aukon ilmastointikanavaan, jota kautta hän luultavasti pääsee eteenpäin. Lara kiipeää kanavaan ja pysähtyy kuullessaan ääniä. Hän katsoo alas ritilän kautta. Luddick.. Ja Eckhardt! Eckhardt on löytänyt Luddickin nuuskimasta ja säälimättömästi tappaa tämän. Hän tekee seinälle myös samanlaisen oudon symbolin, mitä oli Von Croyn asunnossa. Laran täytyy kuitenkin jatkaa matkaa ja hän löytää tien valvomoon. Hän katsoo sähköverkkoa ja vertaa karttaansa rakennuksen pohjapiirrokseen. Lara reitti menee Bio Domen kautta ja päästäkseen sisään, hänen on katkaistava sähköt. Lara katkaisee ne, mutta ei tiedä seurauksia. Sähkösuojus katkeaa myös lukittuna pidetyn olennon kammiosta. Olento pääsee vapaaksi ja tappaa vartijansa. Lara lähtee kohti biologista tutkimuskeskusta.

Astuessaan sisään, ei näytä yhtään siltä, että puutarhan tarkoituksena olisivat pahat aikeet. Kauniissa puutarhassa on monia eksoottisia kasveja ja itse muunneltuja kukkia. Laran täytyy kuitenkin päästä Bio Domeen, joten ei ole aikaa hukattavana. Hän huomaa puutarhan keskellä miehen ja menee tämän luo. Mies osoittautuu biologisen tutkimuskeskuksen johtajaksi ja valottaa Laraa hieman Cabal järjestöstä. He aikovat vallata maan ja vain valitut jatkavat uudella kukoistavalla planeetalla. Lara vain naurahtaa ja vastaa sarkastisesti että jos joka kerta saisi kookospähkinän kun joku sanoo tuollaista… Sitten mies suihkuttaa Laraa jollain tainnuttavalla siitepölyllä ja pakenee. Lara ei jää toimettomaksi vaan löytää paikan josta mies on mennyt. Hän tulee sitten kasvihuoneeseen, jossa puu on lukinnut oven. Lara antaa puulle kuitenkin liikaa ravinneainetta venttiilien avulla ja puu päästää ovista irti. Lara saapuu sitten erittäin suureen kasvihuoneeseen, jota vartioidaan. Laran on saatava vartijoilta henkilökortit saadakseen auki Bio Domen oven. Kerätessään niitä kuolleilta vartijoilta, hän kiipeää kasvihuoneen yläkerroksiin. Vähän ajan päästä, hän kuulee puhetta. Vähän matkan päässä olevalla tasanteella on ihmisiä. Eckhardt, kasvihuonemies Muller, mies, joka oli Louvren galleriassa nimi Gunderson. Lisäksi nainen jota Lara ei ole nähnyt. Eckhardt kutsuu naista nimellä Boaz. Boaz sanoo, että valehteli Eckhardtille tappaneensa Proto Nephiliin. Boaz on pitänyt hengissä muinaisen Nephilim rodun prototyyppiä. Eckhardt on vihainen ja sanoo Boazille että tämä saa maksaa siitä, ettei totellut käskyjä. Muller tuo olennon, jota Boaz sanoo ”koteloksi”. Eckhardt syöttää Boazin tälle olennolle Boazin kiljuessa armoa. Lara katsoo kauhuissaan sivussa. Hän jatkaa matkaansa saatuaan kaikki henkilökortit ja menee auenneesta ovesta. Hän tulee huoneeseen, jossa on kapseleita, joiden sisällä on mutantteja. Osa niistä vapautuu kun Lara astuu huoneeseen. Lara juoksee toiseen kerrokseen ja kiipeää ylhäällä olevalle tasanteelle. Siellä hän vääntää venttiileistä ja yhden kapselin pohja aukeaa. Hän menee aukosta ja laskeutuu viemäriin. Laran seuraava kohde on Vedenalaisen elämän tutkimuskeskus.

Matkallaan tutkimuskeskukseen, Lara jää jumiin eristyskammioon. Ikkunan toisella puolella näkyy tutut kasvot. Mies joka oli Louvressa ja varasti Laran aseet ja Obscura maalauksen. Mies sanoo Laralle että tämän on parempi olla hetken poissa jaloissa, sillä Lara on aiheuttanut tarpeeksi harmia kahden päivän aikana. Mies sanoo Laralle että on turvassa kammiossa ja voi miettiä tekemisiään vähän aikaa. Lara iskee Periapt Shardin ikkunaan. Mies yllättyy ja sanoo sen olevan hänen. Lara kysyy, mikä puukko on ja mies kertoo Laralle sen olevan muinainen Periapt Shard ja niitä on yhteensä kolme. Vain niillä pystyy tappamaan Nephilim rodun edustajan, tai Eckhardtin. Mies lähtee sitten pois Laran luota, jättäen turhautuneen sankarittaren kammioon.

Mies lähtee itse kohti Sanitariumia, Strahovin terveyslaitosta. Sanitarium on Boazin johtoaluetta ja siellä on mutantti-ihmisiä. Mies puhuu yhdelle niistä ja mutanttimies kertoo, että oli vain kuljettamassa rekalla tavaraa laitokseen, kun hullu nainen. Boaz vangitsi hänet sinne. Vangittuja syötetään mustalle enkelille, ”huutajalle” että se olisi tyytyväinen. Huutaja on Proto Nephilim. Mies etsii koodit päästäkseen maksimaaliseen eristyslaitokseen. Hän huomaa, että Proto Nephilim on vapaana siellä. Se on syönyt vartijoita ja kulkee ilmastointikanavissa. Mies lähtee Proton perään. Hän seuraa sitä. Miehellä on myös psyykkisiä voimia ja kykynsä avulla löytää numerokoodeja oviin. Mies vihdoin pääsee Proton luo. Miehellä on onneksi mukanaan yksi Periapt Shardeista ja onnistuu muutaman yrityksen jälkeen tappamaan Proto Nephiliin sillä. Mies lähtee takaisin Laran luokse.

Lara odottaa kammion katossa. Kun mies astuu sisälle, hän hyppää miehen päälle ja potkaisee tämän aseen pois. Hän kääntää miehen vasten seinää ja ottaa Obscuran takaisin. Mies sanoo, että on kai Laralle velkaa tämän. Lara sanoo, että mies on velkaa maalauksen. Mies esittelee itsensä Kurtis Trentiksi. He päättävät tehdä yhteistyötä, sillä heillä on sama maali; tappaa Eckhardt. Kurtis on Lux Veritatis järjestön viimeinen perillinen, koska Eckhardt tappoi hänen isänsä. Kurtis lähtee etsimään viimeistä Periapt Shardia ja Lara viimeistä Obscura maalausta.

Lara astuu sisälle vedenalaisen elämän tutkimuskeskukseen. Hän huomaa vedessä uivan jotain omituista. Mutanttihai, Leviathan. Laran täytyy vältellä vettä. Sisäänpääsy Vault of Trophiesiin, Lux Veritatiksen viimeiseen Obscura maalauksen kätköön. Laran täytyy siis hoitaa Leviathan pois tieltä. Tutkimuskeskuksen yläosassa on hain ruokinta-asema. Lara hoitaa ruuat Leviathanille ja pitää sen kiireisenä. Samalla, hän itse sukeltaa pohjaan. Ensimmäinen luukku on avattu, nyt pitää avata toinen. Lara ui toiseen kammioon ja löytää sieltä märkäpuvun. Hän pistää sen päälle ja sukeltaa syvemmälle. Hän on nyt Vault of Trophiesin sisäänkäynnillä. Lara ui sisälle kammioon, jossa on ritareita ringissä. Kivitaulussa on kirjaimet L ja V ja tekstiä. L ja V täytyy olla nimien etukirjaimia. Lara sukeltaa patsaiden taa, ja niiden takana on nimiä. Lara etsii nimet Vasiley ja Limoux. Vetäessään niiden takana olevista ketjuista, patsaat hajottavat aukon kattoon. Lara sukeltaa aukosta ja saapuu vanhaan huoneeseen. Huoneessa on kaksi luurankoritaria, joten Laran täytyy kiirehtiä. Vipu luukun avaamiseen on huoneen yläosassa joten Lara kiipeää seinää pitkin ylös ja vetää vivusta. Luukun takaa paljastuu viimeinen Obscura. Lara nappaa sen ja menee nopeasti takan kautta ulos. Hän matkaa takaisin veden luo ja ui kohti pintaa. Siellä, häntä odottaa jotain yllättävää. Eckhardt, Muller, Gunderson ja tajuton Kurtis.

Eckhardt onnittelee Laraa siitä, mihin hänen miehensä eivät pystyneet. Nainenhan on melkein amatsoni! Eckhardt käskee Laran antamaan maalauksen hänelle ja Lara ja ystävänsä pääsevät lähtemään. Laralla ei ole muuta vaihtoehtoa, vaan hän heittää maalauksen Eckhardtille ja Gunderson potkaisee Kurtiksen Laran luo. Samassa, oven takaa ilmestyy jotain outoa. Suuri ötökkä, jolla on Boazin pää. Boaz on muuttunut mutantiksi, sen jälkeen kun Eckhardt syötti tämän kotelolle. Samassa, Eckhardt heittää Mullerin Boazille. Boaz tappaa Mullerin ja lähtee kohti Laraa ja Kurtista. Kurtis sanoo, että pystyy hoitelemaan mutantin itsekin ja auttaa Laraa hyppäämään pois. Laran täytyy nyt etsiä itse viimeinen Periapt Shard. Kurtis jää Boazin kynsiin, mutta keksii ampua tältä Boazin selässä olevat kennot. Boazin mutanttiruumis kuolee, mutta yhtäkkiä sen sisältä ilmestyy uusi Boaz, kuin jonkinlainen kärpänen, joka kuoriutuu kotelosta. Kurtis ampuu Boazia ja saa tämän maahan. Kurtis kääntää selkänsä ja samassa Boaz lävistää Kurtiksen mahan piikillään. Kurtis kerkeää käyttää mystistä Chirugai asettaan ja katkaisee Boazin pään. Kurtis kaatuu tajuttomana maahan.

Lara on sillä välin matkalla kohti Kadonnutta Valtakuntaa. Hän juoksee sen outojen ansojen läpi ja päätyy luolaan, jossa on laavaa ja silta. Luolan toisella puolella on ovi, jossa on Cabal järjestön symboli. Lara vetää vivusta, joka on sillan päässä ja juoksee ovelle. Tulivana menee oven syvennyksien läpi ja avaa tien Eckhardtin laboratorioon. Eckhardt on luonut Obscura maalausten osista mystisen kiekon, jolla voi tuhota Nephilim rodun edustajan ja jolla on myös muitakin voimia. Laboratorion toinen osa, jossa Periapt Shard on, on täytetty hapolla. Lara etsii huoneesta ampullit, joissa on ainetta, jolla saa happoveden muunnettua. Eckhardt on piilottanut ne, mutta Lara pienen etsinnän jälkeen löytää ne ja voi sukeltaa Periapt Shardin huoneesta. Samalla, ovi aukeaa. Lara astuu ovesta valtavaan huoneeseen, jonka yläosassa roikkuu aito Nephilim. Laran on nyt päihitettävä Eckhardt tämän omassa pelissään. Eckhardt luo itsestään kopiota ja niiden avulla yrittää tappaa Laran. Lara kuitenkin ehtii iskemään Eckhardtia puukoilla ja kun on iskemässä viimeistä, joku pysäyttää hänet. Lara kääntyy ympäri ja näkee Karel nimisen miehen. Hän työskentelee Eckhardtille ja Eckhardt käskee Karelia tappamaan Laran. Karel, kaikkien yllätykseksi, iskee kuitenkin viimeisen Periapt Shardin Eckhardtin otsaan.

Karel kertoo Laralle, että Eckhardt tietämättään työskenteli hänelle. Kääntyessään, Karel on näyttää oudolta. Hän kertoo olevansa aito Nephilim ja heidän tavoitteena on saada rotu kukoistamaan jälleen. Karel sanoo Laralle että hän oli vähän väliä Laran apuna. Eri muodossa tosin. Hän muuttaa itsensä Bouchardiksi, Luddickiksi ja lopulta, Kurtikseksi. Karel kysyy, haluaisiko Lara olla osa uutta alkua, hän on tarpeeksi vahva liittyäkseen heihin. Lara kysyy että kai Karel vitsailee. Karel sanoo, että omapa on valintasi, typerä kuolevainen.

Lara nappaa Eckhardtin kädestä sen omituisen kiekon. Hän lähtee kiipeämään kohti Nukkuvaa Nephilimiä, jonka Eckhardt on luonut. Hän on tappanut ihmisiä ja tehnyt kokeita saadakseen siihen osia. Eckhardt on elänyt 1300 luvulta lähtien ja on tehnyt sopimuksen Nephilm rodun kanssa. Hän saa elää pidempään, jos auttaa rotua jälleen kukoistamaan. Lara ei anna tämän tapahtua vaan kiipeää viimeisillä voimillaan Nukkuvan Nephilimin luo. Hän hyppää Nephiliin jalkaan kiinni ja laittaa mystisen Obscurakiekon kiinni sen jalkaan. Nephilim alkaa tuhoutua. Lara hyppää äkkiä pois sen luota ja Karel huutaa kauhuissaan. Lara juoksee pois huoneesta jossa tavarat lentelevät ja Nephilim kuolee. Lara lähtee loukkaantuneena etsimään Kurtista, muttei löydä kuin tämän Chirugai aseen. Se kuitenkin hohtaa ja yrittää johdattaa Laraa jonnekin. Se merkitsee sitä, että Kurtis on vielä elossa.

Kirjoittaja: Jessica [tratlantis.com] KOPIOINTI KIELLETTY!