Laran menneisyydessä on tapahtunut kauheuksia, jotka vieläkin kummittelevat hänen mieltään. Ollessaan lentomatkalla äitinsä kanssa himalajan yli, heidän koneeseen tuli vika ja he putosivat vuorille. Kun he olivat etsimässä nuotiotarpeita Buddhalaisen temppelin ympäristöstä, Lara löytää alttarin ja tutkii sitä. Lara koskee kivessä olevaa miekkaa ja samalla alttari aktivoituu. Laran äiti tulee paikalle, ja vetää Laran pois. Alttarin valossa kuitenkin on joku, joka puhuu Laran äidille. Ääni näyttää kehottavan Laran äitiä poistamaan miekan ja hän tekee työtä käskettyä. Samassa Laran äiti katoaa ja Lara jää yksin himalajan hyiseen vuoristoon.

Peli alkaa siitä, kun Lara kiipeilee Bolivian kalliomuodostelmilla. Hän on etsimässä koristeltua kivialttaria, joka viittaisi paikkaan, jossa Laran äiti katosi. Kuitenkin, Tiwanakun temppelillä on muitakin. Suuri määrä palkkasotureita. Lara ei ymmärrä, miten siellä saattaisi olla muitakin. Hän kutsuu heitä turisteiksi. Lara törmää myös James Rutlandiin, mieheen joka on tuonut palkkasoturit paikalle. James kysyy Laralta miekan osista. Lara vain hämmästelee että mistä James on saanut osan ja James kuittaa ettei sillä ole väliä, vaan sillä, mitä se tekee. Ja Lara ei näemmä tätä tiedä. Tämän jälkeen James joukkoineen häipyy. Kuitenkin, Lara löytää kivialttarin - tuhottuna. Mutta huomaa myös, että se on lähes identtinen alttariin, jossa hänen äitinsä katosi.

Lara palaa Englantiin, kotikartanolleen. Siellä hän valmistautuu seuraavaan etappiin ja pyytää avustajiaan, Zipiä, Alisteria sekä aina yhtä luotettavaa palvelijaa Winstonia ottamaan selvää James Rutlandista. Matka kulkee kohti Perua, Paraisoa.

Lara on sopinut tapaamisesta vanhan ystävänsä, Anayan kanssa. Kuitenkin, päästyään paikalle, väki vähenee yllättävästi. Lara epäilee sen johtuvan siitä että täällä ei ole käynyt paljoa ystävällisiä vieraita. Päästyään Anayan luokse, he vaihtavat kuulumiset ja Anaya vie Laran kaivauspaikalle, jossa Lara ja Kent ja Amanda olivat tutkimassa. Anaya sanoo ettei hän halua tulla paikkaan enää. Lara sanoo ettei se haittaa, kunhan Anaya ottaa yhteyttä Zipiin jos jotain tulee.

Lara etsii tiensä kaivauksille. Samassa hänelle tulee takauma nuoruudestaan ja siitä kun hän oli ystäviensä kanssa kaivauksilla. Lara tarkastaa kaivauksien teknistä puolta, eli hänestä näyttää että kaikki osat eivät välttämättä kestä. Amandan kehoituksesta hän kuitenkin tulee perässä kaivauksille. Kun Lara laskeutuu köyttä pitkin, väkipyörä menee rikki. Amanda ei kuitenkaan stressaa köydestä vaan he jatkavat kaivauksia. He kuitenkin vapauttavat jotain karmeaa. Hirviön, joka tappaa lähes jokaisen kaivauksilla. Amanda keksii kuitenkin ottaa amuletin irti seinästä ja hirviö häviää. Samassa kaivaus kuitenkin alkaa romahtaa. Lara ja Amanda juoksevat pois alta, mutta Amanda jäljessä jää kivien väliin loukkuun. Lara juoksee pitämään porttia auki, mutta vesi täyttää kaivauksen. Lara joutuu jättämään Amandan taakseen ja pakenemaan itse.

Nykyajassa, Lara tulee kaivauspaikalle, joka sortui. Hän löytää Amandan kengän, josta puuttuu kengännauhat. Hän uskoo Amandan selviytyneen. Lara löytää myös sen, mitä he olivat etsimässä. Kuningattaren patsaan ja Excaliburin jäljennöksen. "Me olimme niin lähellä..." Laran löydön katkaisee kuitenkin Anaya, joka ilmoittaa että Rutlandin miehet ovat tulossa. Päästyään takaisin maan pinnalle, Lara kertoo Anayalle löydöstään ja he miettivät, voiko olla että Amanda on selviytynyt, ja miksi hän ei ole ilmoittanut itsestään? Onko jotain tapahtunut, jonka hän haluaa pitää itsellään?

Laran matka jatkuu toiselle puolelle maapalloa, Japaniin. Lara muistaa nähtyään miekan palasissa, että hän on nähnyt Tokiossa yhden osista. Valitettavasti, se on nyt Takamoto -nimisellä yakuzapomolla, mutta Lara aikoo saada sen itselleen, hinnalla millä hyvänsä. Hän saapuu vanhan ystävänsä Nishimuran juhliin. Nishimura varoittelee Laraa Takamotosta, mutta Lara on päättäväinen. Hän lähtee ajamaan takaa Takamotoa ja Nishimuran juhlien rakennuksen katolta, hän pääsee Takamoton toimistolle. Takamoto ja Lara ottavat yhteen, mutta Lara saa kuin saakin miekan osan Takamoton hyppysistä. Seuraava kohde: James Rutland.

Ghanassa, Länsi-Afrikassa, piileksii James Rutland. Laskeutuessaan Ghanan sademetsiin, Zip sanoo Laralle, että Laran isä kuulemma työskenteli tällä kaivauksella, kun Lara ei ollut vielä syntynyt. Lara on kuitenkin keskittynyt palkkasotureihin, jotka siirtelevät laatikkoja kuilun yli. Lara aikoo etsiä toisen tien rakennukselle. Hän hyppää alas vesiputoukselle ja selvittää muinaisen mekanismin, jolla hän saa portit auki. Kun Lara pääsee temppelin raunioille, siellä häntä odottaa lisää sydäntälämmittäviä puzzleja ja mekanismeja. Vaaraa rakastava Lara haluaa saada ansat toimimaan, ja sitten vasta jatkaa niiden kautta eteenpäin. Temppelin päässä, Lara vihdoin löytää James Rutlandin. James kertoo Laralle Ghalalin avaimesta, joka yhdistää miekan osat ja onko Lara tietoinen sen sijainnista. Kun James on saanut tarpeeksi jutustelusta, hän alkaa kehuskelemaan miekan osan voimilla. "Pystytkö tähän Lara?". Lara kuitenkin vuosien kokemuksella päihittää Rutlandin ja saa miekan osan itselleen.

Kazakhstan, Venäjä. Laran seuraava etappi on hyisessä Kazakstanissa, jossa sijaitsee venäläisten neuvostoliiton aikainen salainen laitos, joka tutkii paranormaaleita ilmiöitä. Projekti Carbonek viittaa Excaliburiin ja Lara lähtee ottamaan asiasta selvää. Laitoksella on kaikesta huolimatta vielä vartiointi päällä ja Lara miettii, onko Amanda tullut tänne. Kun Lara saa laitoksen sähköt toimimaan, hän lähtee syvemmälle laboratorioihin. Siellä hän törmää kuin törmääkin paljon muuttuneeseen Amandaan. Amanda on ottanut Perussa heidän ystävänsä tappaneen hirviön itselleen, amuletin mukana. Lara kauhistuu, millaiseksi Amanda on muuttunut. Kuitenkin, hänen on saatava miekan osa ennen Amandaa. Lara käyttää tulevaisuuden teknologiaa, jota venäläiset ovat tutkineet - ja epäonnistuneet sen käytössä - Tesla-ase. Sen avulla, Lara saa vedettyä miekan osan suojastaan. Amanda pakenee, kun ase on taas epävakaa ja Lara tippuu sen tekemään halkeamaan. Lara ryömii tiensä ulos ja ilmoittaa kartanon tiimille, että seuraava kohde on Cornwall, sehän on ihan naapurissa.

Takaisin kotikunnilla, Englannin Cornwallissa, Lara lähtee tutkimaan Kuningas Arthurille pyhitettyä museota ja väitettä, että Arthurin hauta olisi siellä. Tutkittuaan museon takaosat, Lara on varma, ettei hauta ole täällä. Kuitenkin, hän ei luovuta vielä. Lara tutkii edemmäs ja murtaa seinän vale-hautakammiossa. Alkaa näyttää lupaavalta... Vanhat ruostuneet ansat ovat jokseenkin vielä toiminnassa. Kun Lara pääsee niiden läpi, näkee hän henkeäsalpaavan näyn. Maanalainen kalliotunneli, valtava sellainen - ja Kuningas Arthurin oikea hautakammio. Lara menee Arthurin patsaan luo, jolla on käsissä viimeinen pala Excaliburia. Hän pahoittelee Arthurille, ettei ottaisi osaa, ellei se olisi täysin välttämätöntä. Palatessaan takaisin päin, Lara kuitenkin törmää odottamattomaan esteeseen. Kalliotunnelin vedestä nousee valtava merihirviö. Lara löytää kuitenkin keinot sen ohittamiseen ja pääsee jatkamaan matkaa. Palattuaan museoon, Zip ja Alister on vangittuna. Lara hoitaa sotilaat kuitenkin vaivatta ja tiimi lähtee kohti kartanoa.

Tässä vaiheessa, Lara ei tiedä mitä seuraavaksi. Missä on Ghalalin avain, josta James Rutland puhuu. Miettiessään tiiminsä kanssa, Lara kääntää katseensa vanhempiensa tauluun. Siinä hän huomaa mielenkiintoisen yksityiskohdan... Laran äidin rintakoru! Siinä on samanlaiset ornamentit kuin Excaliburissa. Laran äiti oli saanut sen Laran isältä, hukattuaan lempirintakorunsa. Nyt Lara tietää, mistä lähteä sitä hakemaan. Seuraava kohde on Nepal, Himalajalla. Paikka, missä Lara menetti äitinsä, paikka, joka vieläkin kummittelee Laran mielessä.

Himalajalla, Lara etsii lentokoneen hylyn. Vanha koneen runko on todella epävakaa ja palasina, mutta Lara löytää Ghalalin avaimen rungosta. Lara sanoo äitinsä vaalineen korua ja hän ei tiennyt koskaan, että mikä se oikeasti on. Zip kyselee Laraa jo takaisinpäin vaarallisilta vuorilta, mutta Lara sanoo, että on vielä yksi paikka jossa hän haluaa käydä. Lara etsiytyy Buddhalaistemppelille, jossa hänen äitinsä katosi. Hän kyyristyy viimeiselle kivialttarille ja yhdistää Excaliburin. Nostettuaan sen ylös kokonaisena ja testattuaan sitä, Lara hymähtää ja sanoo että nyt tiedetään, miten nuoresta Arthurista tuli Kuningas Arthur. Lara sanoo tiimilleen, että on vielä yksi etappi. Takaisin Boliviaan.

Lara palaa Bolivian kivialttarille, jossa on myös Amanda, Rutland, sekä palkkasotureita. Excaliburin avulla, sotureista ei ole vastusta. Amanda on kuitenkin päättänyt, että hän on se, joka iskee miekan kiveen takaisin. Amanda herättää Perusta tutun hirviön ja yhdistyy sen kanssa. Vaikean taistelun jälkeen, Lara hoitelee hirviön ja on iskemässä miekkaa takaisin kiveen, kun Amanda huutaa hänelle, että hänen piti tehdä se, hänen piti avata Avalon! Lara näkee äitinsä kivirenkaan toisella puolella ja huutaa äidilleen, ettei koske miekkaan. Laran äiti ei kuitenkaan ymmärrä, että se on hänen aikuinen tytär joka siellä puhuu, vaan sen sijaan kuulee Amandan varoituksen Laralle, että hänen pitää poistaa miekka kivestä, muuten alttari tuhoutuu. Laran äiti, joka ei tiedä varmasti mitä tehdä, mutta haluaa suojella tytärtään, vetää miekan irti ja joutuu Avaloniin. Lara hurjistuu saadessaan nyt tietää, että äitinsä katoaminen on Amandan syytä. Amanda selittää Laralle, ettei Laran äiti ole kuollut, vaan Avalonissa, jonne Amandan kohtalo olisi ollut mennä. Lara huutaa Amandalle, mutta Amanda vastaa ettei Lara koskaan ymmärtäisi. Vihainen äitinsä kohtalosta, Lara huutaa Amandalle, että tämän jokainen hengenveto tästä lähtien on Laran lahja.

Lara poistuu Alttarilta ja kertoo tiimilleen, että tehdä järjestelyjä, heillä on vielä töitä.

LOPPU

(C) TRATLANTIS - ÄLÄ KOPIOI!!